CBRC
915 subscribers
221 photos
17 videos
5 files
138 links
Computational Biology Research Center of Amirkabir university, computer science faculty

http://bioinformatics.aut.ac.ir

https://www.aparat.com/bioinformatics_aut

Admin: @CBRCAdmin
Download Telegram
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
🔔 جلسه تا دقایقی دیگر آغاز می‌گردد...

شروع جلسه از ساعت ۱۹

🌐 لینک جلسه:

https://www.skyroom.online/ch/ibis/biogap
Forwarded from Iranian Bioinformatics Society (IBIS) (M_Rastegari)
✏️  دومین سمپوزیوم دانشجویی انجمن بیوانفورماتیک ایران

این سمپوزیوم با هدف ایجاد آشنایی اولیه برای شرکت‌کنندگان، به صورت ورکشاپ‌های سه ساعته آنلاین از ۲۳ بهمن تا ۲۷ بهمن ۱۴۰۲ به صورت جلسات شبانه برگزار خواهد شد.



🔹با اعطای گواهینامه معتبر
🔸هزینه ثبت نام در هر کارگاه: ۲۰۰ هزار تومان
🔹 امکان ثبت نام در هر  کارگاه به صورت جداگانه

@IranianBioinformaticsSociety
@CBRC_aut
Forwarded from Iranian Bioinformatics Society (IBIS) (M_Rastegari)
🔸دومین سمپوزیوم دانشجویی انجمن بیوانفورماتیک ایران

✏️ Molecular Docking and Virtual Screening in Drug Discovery: A Hands-On Approach



📝خلاصه ارائه:
این ارائه یک رویکرد سیستماتیک برای طراحی دارو به روش Rigid Docking با استفاده از دو نرم افزار Molegro و Avogadro معرفی می‌کند و در آن پس از بیان و مرور پیش‌زمینه های مورد نیاز به شکل عملی یک دارو برای ویروس SARS-COV2 معرفی خواهیم کرد که طبق مراحل زیر خواهد بود:

• آماده سازی
• اجرای Docking
• بررسی و آنالیز نتایج
• بازخورد گرفتن و اصلاح داروهای احتمالی

👤توسط: مسعود مهدوی‌فر، دانشجوی کارشناسی ارشد دانشگاه صنعتی امیرکبیر

📅 زمان: ۲۳ بهمن ۱۴۰۲، ساعت ۱۷ الی ۲۰
هزینه: ۲۰۰ هزار تومان

🔸با ارائه مدرک معتبر پس از پایان سمپوزیوم

🔹ثبت‌نام ازطریق لینک

@IranianBioinformaticsSociety
@CBRC_AUT
Forwarded from Iranian Bioinformatics Society (IBIS) (M_Rastegari)
🔸دومین سمپوزیوم دانشجویی انجمن بیوانفورماتیک ایران

✏️ Molecular dynamics simulation using VMD and NAMD


📝خلاصه ارائه:

آشنایی اولیه با نرم افزار VMD و NAMD .

آشنایی با سایت rcsb.org  و دیتا بیس PDB .

آشنایی با انواع فایلهای ساختاری pdb و topology  و ...

نمایش انواع مولکولها در VMD .

ساخت فایل PSF برای پروتیین و لیگاند‌ توسط نرم افزار VMD و سایت  CHARMM-GUI.ORG.

آشنایی با دینامیک مولکولی و نحوه ی محاسبه ی واکنشهای بین مولکولی توسط نرم افزار NAMD .

آنالیز خروجی های NAMD و نیروهای بین مولکولی.

در این کارگاه سعی شده موارد فوق برای پروتیین های غشایی ویروس COVID-19 و لیگاندهای مختلف، بررسی شود.

👤توسط:نوید وزیری‌نسب، دانشجوی کارشناسی ارشد دانشگاه صنعتی امیرکبیر

📅 زمان: ۲۴ بهمن ۱۴۰۲، ساعت ۱۷ الی ۲۰
هزینه: ۲۰۰ هزار تومان

🔸با ارائه مدرک معتبر پس از پایان سمپوزیوم

🔹ثبت‌نام ازطریق لینک

@IranianBioinformaticsSociety
@CBRC_AUT
Forwarded from Iranian Bioinformatics Society (IBIS) (M_Rastegari)
🔸دومین سمپوزیوم دانشجویی انجمن بیوانفورماتیک ایران

✏️ An introduction to machine learning for bioinformatics


📝خلاصه ارائه:

هدف از برگزاری این کارگاه آشنایی با ظرفیت‌های یادگیری ماشین برای داده‌های بیوانفورماتیک است. در این کارگاه علاوه بر آشنایی اولیه با مفاهیم و الگوریتم‌های یادگیری ماشین و داده‌های بیوانفورماتیک، به صورت عملی به تعریف و پیاده سازی یک مسئله واقعی می‌پردازیم.

سرفصل‌ها:
• آشنایی با مبانی یادگیری ماشین و کابرد آن در تحلیل داده‌های بیوانفورماتیک
• آشنایی با الگوریتم‌های کلیدی یادگیری ماشین
• پیاده‌سازی یک مسئله ساده بیوانفورماتیکی و درگیری با چالش‌های داده و تحلیل آن‌ها
• آشنایی با چالش‌های پیش‌رو مسائل یادگیری ماشین و بیوانفورماتیک و گام‌های بعدی در مسیر یادگیری


👤توسط:متین قاسمی، دانشجوی کارشناسی ارشد دانشگاه صنعتی امیرکبیر

📅 زمان: ۲۵ بهمن ۱۴۰۲، ساعت ۱۷ الی ۲۰
هزینه: ۲۰۰ هزار تومان

🔸با ارائه مدرک معتبر پس از پایان سمپوزیوم

🔹ثبت‌نام ازطریق لینک

@IranianBioinformaticsSociety
@CBRC_AUT
Forwarded from Iranian Bioinformatics Society (IBIS) (M_Rastegari)
🔸دومین سمپوزیوم دانشجویی انجمن بیوانفورماتیک ایران

✏️ آنالیز داده های بیان ژن در سطح تک سلولی


📝خلاصه ارائه:

۱. آشنایی کلی با مفاهیم آنالیز بیان ژن
۲. معرفی تکنولوژی های RNA-SEQ در سطح تک سلولی و اهمیت مطالعات در این حوزه
۳. معرفی و دریافت داده های بیان ژن تک سلولی
۴. آناليز اختصاصی و پیش پردازش اولیه داده ها
۵. پیاده سازی و بازتولید یک مطالعه در حوزه سرطان

پیشنیاز: برنامه نویسی R

👤توسط: مژگان مظفری‌لقا- دانشجوی دکتری بیوانفورماتیک-دانشگاه تهران

📅 زمان: ۲۶ بهمن ۱۴۰۲، ساعت ۱۷ الی ۲۰
هزینه: ۲۰۰ هزار تومان

🔸با ارائه مدرک معتبر پس از پایان سمپوزیوم

🔹ثبت‌نام ازطریق لینک

@IranianBioinformaticsSociety
@CBRC_AUT
Forwarded from Iranian Bioinformatics Society (IBIS) (Mohaddeseh keyhanian)
📣 تنها 1روز تا پایان مهلت ارسال مقالات باقی مانده است.

📆 مهلت ارسال مقالات: ۱۵ بهمن ماه ۱۴۰۲

جهت اطلاعات بیشتر به سایت همایش مراجعه فرمایید:
🌐 icb12.ibis.org.ir
Forwarded from Iranian Bioinformatics Society (IBIS) (M_Rastegari)
💭 سلسله جلسات بایوگپ(BioGap)

در چهارمین و آخرین جلسه بایوگپ امسال، میزبان دکتر چنگیز اصلاحچی و دکتر سجاد قرقانی هستیم.

در این جلسه با هدف نقد و بررسی «طراحی دارو و پزشکی دقیق» به گفتگو با این دو استاد بزرگوار می‌پردازیم.

❗️ این جلسه در بستر اسکای روم برگزار می گردد و ورود برای عموم آزاد و رایگان است.

دوشنبه، ۱۶ بهمن ماه ۱۴۰۲ ساعت ۱۹

🌐 لینک جلسه:
https://www.skyroom.online/ch/ibis/biogap



@IranianBioinformaticsSociety
Forwarded from Iranian Bioinformatics Society (IBIS) (M_Rastegari)
🔸دومین سمپوزیوم دانشجویی انجمن بیوانفورماتیک ایران

✏️ Approaches in feature extraction of gene expression data


📝خلاصه ارائه:


۱. آشنایی با مفاهیم بیان ژن و تکنولوژی‌های مطالعه آن
۲. آشنایی با کاربردهای داده‌های بیان ژن و چالش‌های آن
۳. آشنایی با مسیرهای زیستی
۴. معرفی روش‌های استخراج ویژگی از داده‌های بیان ژن به ویژه روش‌های تبدیل داده‌های بیان ژن به داده‌های بیان مسیر زیستی
۵. معرفی روش‌های یادگیری ماشین برای آنالیز داده‌های بیان ژن
۶. پیاده سازی چند روش استخراج ویژگی از داده‌های بیان ژن و آنالیز آن با روش‌های یادگیری ماشین

👤توسط: ریحانه مرتضایی- دانشجوی کارشناسی ارشد بیوانفورماتیک دانشگاه صنعتی امیرکبیر

📅 زمان: ۲۷ بهمن ۱۴۰۲، ساعت ۱۷ الی ۲۰
هزینه: ۲۰۰ هزار تومان

🔸با ارائه مدرک معتبر پس از پایان سمپوزیوم

🔹ثبت‌نام ازطریق لینک

@IranianBioinformaticsSociety
@CBRC_AUT
📝۴ روز تا شروع دومین دوره از سمپوزیوم دانشجویی انجمن بیوانفورماتیک ایران با همکاری آزمایشگاه زیست محاسباتی CBRC

🔸۲۳ بهمن ماه:Molecular Docking and Virtual Screening in Drug Discovery: A Hands-On Approach

🔹۲۴ بهمن ماه:Molecular dynamics simulation using VMD and NAMD

🔸۲۵ بهمن ماه:An introduction to machine learning for bioinformatics

🔹۲۶ بهمن ماه: آنالیز داده های بیان ژن در سطح تک سلولی

🔸۲۷ بهمن ماه:Approaches in feature extraction of gene expression data


💸هزینه هر دوره: ۲۰۰ هزار تومان

🌐به صورت آنلاین

🏅با ارائه گواهی معتبر

@IranianBioinformaticsSociety
@CBRC_AUT
📝با تشکر از اعتماد شما و ثبت نام در رویداد سمپوزیوم دانشجویی،

🔹به اطلاع می‌رساند ایمیل حاوی لینک، نام کاربری و رمز عبور یک روز پیش از برگزاری جلسه برای شما ارسال خواهد شد.

🔸آخرین زمان برای قطعی نمودن ثبت نام و شرکت در هر یک از دوره‌ها، تا ساعت ۱۵ همان روز خواهد بود.

با تشکر از توجه شما،
تیم اجرایی دومین سمپوزیوم دانشجویی انجمن بیوانفورماتیک ایران

@CBRC_AUT
@IranianBioinformaticsSociety
مراسم بزرگداشت زنده یاد دکتر عباس نوذری دالینی

استاد برجسته علوم کامپیوتر دانشگاه تهران و از پیشگامان بیوانفورماتیک در ایران

دوشنبه ۳۰ بهمن ۱۴۰۲
ساعت ۱۰:۳۰ الی ۱۲

دانشکدگان علوم دانشگاه تهران
سالن دهشور
📋 جلسات هفتگی ژورنال کلاب CBRC

در این رویداد دور هم دیگر جمع می‌شیم تا با بررسی آخرین مطالعات صورت گرفته در حوزه بیوانفورماتیک، به نقد و بررسی آن‌ها بپردازیم. هدف این جلسات آگاهی از مسائل و زمینه های لازم برای انجام کار تحقیقاتی در این حوزه است.


آغاز جلسات از چهارشنبه ۲ اسفند، ساعت ۱۲ تا ۲ در دانشکده علوم ریاضی

🔔 جزییات بیشتر هر جلسه، در کانال آزمایشگاه اطلاع‌رسانی خواهد شد.

@CBRC_AUT
📋 جلسات ژورنال کلاب CBRC

آزمایشگاه زیست محاسباتیCBRC در راستای افزایش دانش جمعی، سلسله جلسات ژورنال کلاب را برگزار می‌نماید.

🔔 در جلسه اول ابتدا معرفی آزمایشگاه صورت گرفته و در ادامه اولین جلسه علمی برگزار می‌گردد.

👤 ارائه دهنده: مهسا سعادت، دانشجوی دکتری علوم کامپیوتر دانشگاه صنعتی امیرکبیر

📚 موضوع: یادگیری تقویتی عمیق برای طراحی دارو

زمان: چهارشنبه ۲ اسفند ماه، ساعت ۱۲ تا ۱۴

@CBRC_AUT
📣 اطلاعیه

به دلیل برگزاری کنفرانس بین المللی بیوانفورماتیک ایران در روزهای ۴شنبه و ۵ شنبه و حضور بخشی از پژوهشگران مرکز به‌عنوان کادر اجرایی در این رویداد بزرگ، این هفته، چهارشنبه ۹ اسفند، جلسه ژورنال کلاب CBRC برگزار نمی‌گردد
📋 جلسات ژورنال کلاب CBRC

آزمایشگاه زیست محاسباتیCBRC در راستای افزایش دانش جمعی، سلسله جلسات ژورنال کلاب را برگزار می‌نماید.

👤 ارائه دهنده: سبحان احمدیان مقدم، دانشجوی ارشد بیوانفورماتیک دانشگاه صنعتی امیرکبیر

📚 موضوع: سامانه‌های پادویروسی در باکتری‌ها

زمان: چهارشنبه ۱۶ اسفند ماه، ساعت ۱۲ تا ۱۴

👥 به صورت حضوری

❗️ حضور برای عموم آزاد است.

@CBRC_AUT
Forwarded from RSG - Iran
📌نخستین سمینار پیشرفته‌ی زیست‌شناسی محاسباتی، بیوانفورماتیک و سلامت (HBC 2024)

🖇با حضور برجسته‌ترین اساتید و پژوهشگران این حوزه از سراسر جهان!

-از دانشگاه Harvard: دکتر علیرضا حقیقی و دکتر عطا کیاپور
-از دانشگاه Cambridge: دکتر محمد لطف‌اللهی
-از Broad Institute: دکتر Anne Carpenter
-از دانشگاه Boston: دکتر کیهان بتمن قلیچ
-از دانشگاه صنعتی شریف: دکتر محمدحسین رهبان و دکتر علی شریفی زارچی

🔥با حضور افتخاری پروفسور Pavel Pevzner، نویسنده‌ی کتاب ارزشمند Bioinformatics Algorithms از دانشگاه UCSD

🗓۲۳ و ۲۴ اسفندماه ۱۴۰۲

🔗رویداد آنلاین

🔖مهلت ثبت‌نام: ۲۲ اسفند ۱۴۰۲

🔥ثبت‌نام زودهنگام با ۳۰ درصد تخفیف
تا ساعت ۲۴ فرداشب(چهارشنبه، ۱۶ اسفند)

✔️لینک ثبت‌نام:
https://rayazi.com/events/hbc-2024

📃همراه با صدور #گواهی_حضور در سمینار از طرف شاخه‌ی دانشجویی انجمن‌ جهانی زیست‌شناسی محاسباتی در ایران (ISCB)

Telegram | LinkedIn | Instagram
📋 جلسات ژورنال کلاب CBRC

آزمایشگاه زیست محاسباتیCBRC در راستای افزایش دانش جمعی، سلسله جلسات ژورنال کلاب را برگزار می‌نماید.

👤 ارائه دهنده: امیر ضرغامی،
دانشجوی ارشد بیوانفورماتیک دانشگاه صنعتی امیرکبیر

📚 موضوع:مرور و بررسی شبکه‌های ceRNA

زمان: چهارشنبه ۲۳ اسفند ماه، ساعت ۱۲ تا ۱۴

👥 به صورت حضوری

❗️ حضور برای عموم آزاد است.
📋 جلسات ژورنال کلاب CBRC

آزمایشگاه زیست محاسباتیCBRC در راستای افزایش دانش جمعی، سلسله جلسات ژورنال کلاب را برگزار می‌نماید.

👤 ارائه دهنده: زهرا قربانعلی،
دانش‌آموخته دکتری دانشگاه صنعتی امیرکبیر

📚 موضوع: پیش‌بینی روابط درمانی دارو‌ها و میکروب‌ها

زمان: چهارشنبه ۵ اردیبهشت ماه، ساعت ۱۵ الی ۱۶

👥 به صورت حضوری

❗️ حضور برای عموم آزاد است.
📋 جلسات ژورنال کلاب CBRC

آزمایشگاه زیست محاسباتیCBRC در راستای افزایش دانش جمعی، سلسله جلسات ژورنال کلاب را برگزار می‌نماید.

👤 ارائه دهنده: میلاد بشارتی فرد،
دانشجوی دکتری دانشگاه صنعتی امیرکبیر

📚 موضوع: پیش‌بینی هم افزایی خاصیت دارویی با استفاده از شبکه های عصبی گراف

زمان: چهارشنبه ۱۲ اردیبهشت ماه، ساعت ۱۵ الی ۱۶

👥 به صورت حضوری

❗️ حضور برای عموم آزاد است.